O número de domínios e subdomínios que pode proteger com o mesmo certificado SSL depende do tipo de certificado.
Certificados como o Rapid SSL e o True BusinessID EV protegem apenas 1 domínio e tudo o que estiver para a frente do mesmo (por exemplo, www.omeudominio.com e wwww.omeudominio.com/loja). Não cobrem no entanto subdomínios (como por exemplo loja.
Para proteger um domínio e todos os seus subdomínios com o mesmo certificado deverá optar por um certificado wildcard como o Rapid SSL Wildcard ou True BusinessID Wildcard